Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms