Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPAG9O60271 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPAG9O60271 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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