Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PDE6DO43924 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PDE6DO43924 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDE6DO43924 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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