Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CREB3O43889 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CREB3O43889 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB3O43889 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB3O43889 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB3O43889 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB3O43889 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB3O43889 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB3O43889 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms