Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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