Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
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