Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TO15178 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TO15178 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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