Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNJ2O15056 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms