Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CROCC2H7BZ55 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCC2H7BZ55 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms