Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A6NL46 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A6NL46 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A6NL46 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A6NL46 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A6NL46 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A6NL46 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A6NL46 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A6NL46 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A6NL46 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A6NL46 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A6NL46 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A6NL46 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A6NL46 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A6NL46 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A6NL46 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms