Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms