Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC182A6NF36 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms