Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
XIRP2A4UGR9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms