Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms