Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54L2Q9Y4B4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RAD54L2Q9Y4B4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms