Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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