Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HPS5Q9UPZ3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS5Q9UPZ3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS5Q9UPZ3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS5Q9UPZ3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS5Q9UPZ3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS5Q9UPZ3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS5Q9UPZ3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS5Q9UPZ3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS5Q9UPZ3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPS5Q9UPZ3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS5Q9UPZ3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS5Q9UPZ3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS5Q9UPZ3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS5Q9UPZ3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPS5Q9UPZ3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms