Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB23Q9ULC3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms