Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN11AQ9UI33 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms