Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms