Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms