Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL28Q9NXS3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms