Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TBCCD1Q9NVR7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms