Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms