Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms