Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms