Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4GALTQ9NPC4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms