Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms