Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms