Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms