Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms