Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms