Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms