Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms