Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms