Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms