Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHOX2BQ99453 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2BQ99453 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms