Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms