Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARXQ96QS3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms