Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC38A2Q96QD8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms