Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms