Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms