Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms