Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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RABGGTAQ92696 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RABGGTAQ92696 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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RABGGTAQ92696 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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RABGGTAQ92696 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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RABGGTAQ92696 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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RABGGTAQ92696 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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RABGGTAQ92696 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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RABGGTAQ92696 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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