Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIPC3Q8TF64 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms