Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TMIEQ8NEW7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TMIEQ8NEW7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TMIEQ8NEW7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMIEQ8NEW7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIEQ8NEW7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIEQ8NEW7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIEQ8NEW7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIEQ8NEW7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIEQ8NEW7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIEQ8NEW7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIEQ8NEW7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIEQ8NEW7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIEQ8NEW7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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