Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms