Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms