Protein–RNA interactions for Protein: Q8N945

PRELID2, PRELI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID2Q8N945 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRELID2Q8N945 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRELID2Q8N945 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRELID2Q8N945 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRELID2Q8N945 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRELID2Q8N945 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PRELID2Q8N945 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRELID2Q8N945 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRELID2Q8N945 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRELID2Q8N945 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRELID2Q8N945 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRELID2Q8N945 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRELID2Q8N945 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms