Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LNX2Q8N448 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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